民國六十五年八月，臺北市政府為因應松山區 人口成長與地方急速繁榮，於是年八月選派陳 必讀先生擔任籌備處主任，於松山國中（現松 山高中）成立本校籌備處，展開建校規劃事宜 ，以解決本區子弟就學問題。 建校之始，篳路藍縷，幸蒙地方人士及學生家 長熱心支持，第一期建校工程，計普通教室十 七間、特別教室八間、會議室一間、辦公室八 間、圖書室一間及其他附屬工程。民國六十六 年七月一日本校正式成立，陳必讀先生為首任校長，是年八月一日招收一年級新生十班，次年再招收新生十四班，六十八年又招收新生十二班，合計三十六班，學生一千六百餘人，教職員工百餘人。 民國七十七年八月由趙
吉林先生接任校長，一本陳校長創校之教育理念與建設藍圖，積極提升學生素質、加強生活教育、充實教學設備、延攬優秀師資，建設永吉國中成為理想教育環境。 民國八十六年二月徐月娥女士接任第三任校長，積極推展九年一貫教育，提供豐富多元教學，建立永吉學生圖像，以愛為核心，以生命教育為經，完全學習為緯，融入生活經驗，培養學生知法守法，尊重生命的人文素養，主動探索研究；積極結合親師生以卓越創新精神，開發學生多元智慧，提升問題解決能力，使吉園學子能夢想未來，築夢踏實，達到全人發展的教育目標。在徐校長帶領之下，吉園氣象一新，績效卓著，於八十八年榮獲臺北市教育局頒發推展家庭教育績優團體，八十九年榮獲國中輔導學會評選為輔導績優學校，九十年榮獲臺北市教育局評鑑為特教績優學校，九十二年度校務評鑑榮獲六項特優，成為六星級學校。 民國九十二年八月林美雲女士接任第四任校長，注重教育理念的融入，以收潛移默化之功能。推動教學卓越化，以激發學生潛能，協助適性發展；促進校園活動民主化，培養學生自治自立精神；拓展活動多元化，豐富學生學習生活；並融入社區資源，為培養未來的卓越社區公民而努力。在林校長領導下，「九年一貫課程優質教育教學創新專業發展徵稿活動」榮獲團體獎首獎，臺北市第四屆及第五屆「教育專業創新與行動研究成果發表」皆或團體獎項，本校的籃球隊、游泳隊、巧固球隊等參加全國性比賽皆戰功彪炳，每年話劇對外公演，以本校特色之一，成立三年之男生合唱團亦於九十六年代表臺北市參加台湾音樂比賽榮獲國中組第一名，各項表現屢獲佳績，充分展現永吉師生蹈厲奮發，與時具進的精神。 民國九十八年八月林採有女士接篆視事，將本著有教無類、因材施教之教育理念，以愛為核心，用三生(生命、生活、生態)為內容，形塑六零環境，營造安全、活力、創意、快樂的學習環境，提供學生適性發展機會，並培育學生帶著走的能力，達成教育111，實現學生完全學習、全人發展教育目標。