合肥市第四十六中学外形别具一格的教学实验楼与教师办公楼构成和谐的统一体，其南面是一个总面积为2000多㎡的操场和标准篮球场，并铺设了人工草坪，通过校园改造增加了有效的活动空间3200㎡。教学实验楼有地下自行车停车场1300多㎡，可停放全校师生自行车；一楼大厅1300多㎡，可供全校师生集会及上室内体育课；二楼平台600多㎡，不但可供学生课间活动，也可用来上体育课。按照义务教育达标要求，为加强素质教育，培养国家需要的合格人才，学校多方筹集资金，逐步配齐各种教学设施，现有物理实验室两个、化学、生物实验室各一个；两个微机室、两个多媒体室，还配有多媒体学术报告厅、语音室、科技活动室、图书室、师生阅览室、音乐室、美术室、乒乓球馆等，各器室均投入正常使用。
上世纪经过几代人的奋斗积淀，合肥四十六中教育教学成绩突出，多次受到省、市、区教育主管部门的表彰和奖励，成为闻名省城的初级中学。站在新世纪的门槛上，面临新课程改革的时代浪潮，经过长期的反思、论证和专家指导，结合实际，学校提出了“凸显科普特色，促进全面发展”的特色建设构想，坚定走特色化办学之路，大力开展校本教研活动，以教育科研促学校质量，以教师成长促学生发展。注重培养学生的科学精神、创新意识、实践能力，力求让每一个学生都获得个性化的发展空间。
在新的办学理念的引领下，经过全体教职工的艰苦奋斗，学校的特色建设已经取得了初步成效。教育教学成绩显著，学生的生命在特色教育过程中放出了光彩，中考成绩稳中有升，省、市示范高中的达线率为60%左右，毕业生受到高一级学校的普遍欢迎。在各级各类竞赛中获奖面大，等次高。乒乓球比赛，已连续20年获合肥市初中组男、女团体及单打第一。近年来信息学竞赛硕果累累，学校已连续4年获得合肥市团体一等奖。2006年省青少年信息学竞赛中，以学校学生为主组建的合肥市代表队取得了历史性的突破，荣获初中组团体第一名，且省第一、二、三、五名皆为本校学生。
在科技创新竞赛方面亦成绩喜人。在创办特色学校的过程中，也涌现了一批科普教育的带头人，成为学校的中坚力量。近几年来，有两名教师获国家级优质课评比二等奖；16名教师获省市“教坛新星”及优质课评比一等奖；30多人次获得区级“教坛新星”及优质课评比一等奖。教师获奖或发表教育教学论文四百余篇。学校综合实力逐步提高，04年、05年连续两年获庐阳区教育教学成果一等奖。2004至2005年学校先后顺利通过区、市级特色学校验收，荣获首批“合肥市特色初中”称号。近几年学校被评为合肥市科普示范学校，合肥市实验性、示范性校本教研基地，合肥市甲级管理学校，省体育传统项目学校等。
2007年7月始，根据市委、市政府决定，合肥46中与合师附校初中部合并，整建制迁入滨湖新区，校名仍为“合肥市第四十六中学”，隶属于包河区教育局，成为合肥市第一所公办全日制寄宿制初级中学。
学校现有教师180名，其中党员88名，高级职称55人，具有本科学历教师150人，学历合格率100%；各学科均有学科带头人和相对稳定的老中青三结合的专职老师，他们学有专攻，教有所长，治学严谨，师德高尚。
学校现有47个教学班，近2900名学生，在优良校风、严谨教风的熏陶下，学生文明守纪、勤奋学习、积极向上、多才多艺、全面发展，受到高一级学校的普遍欢迎。
多年来，中考成绩名列全市前茅，乒乓球连续21年获市初中男女团体冠军，信息学、科技创新和电脑机器人等比赛获奖等级高、人次多，连续多年名列合肥市第一，实现了合肥市、安徽省的历史性突破。
学校先后被评为安徽省体育传统项目学校、合肥市特色初中、合肥市科普示范学校、合肥市文明单位、合肥市甲级管理学校、综合治理模范单位、绿化先进单位、双拥模范单位和创建国家卫生城市先进单位等。
强强联手办新校，励精图治铸辉煌。新的合肥46中将充分发挥名牌学校和公办寄宿制学校两大优势，按照设施一流、设备一流、师资一流、管理一流、服务一流、质量一流的标准，高起点、高品位地建设成独具魅力的滨湖新校；我们将开好局，起好步，三年显成效，五年铸辉煌，努力成为全国知名、全省一流的名牌特色初中，以扩大优质教育资源的社会效益，更好地满足人民群众“好上学、上好学”的需求，为合肥市教育均衡发展、合肥市现代化滨湖大城市建设做出贡献。