合肥研究院设置院级管理机构，设院长一名、副院长三名。院下设办公室，具体负责研究院日常工作，设研究中心、咨询服务部、培训部和校友通联部负责相关工作的开展与管理。研究院位于合肥市胡岗路13号（安徽财贸职业学院东区），合肥钢铁公司对面，占地面积近30亩，设施齐全，交通便利。名誉院长：黄传新院长：周加来（兼）副院长：汪雷、朱道才、胡在新（兼）1.办公室。办公室由安徽财经大学调派人员组成，设主任一人，秘书若干名，主要负责研究院日常工作和对外联络，配合学校开展与研究院相关活动的策划、组织、宣传等工作。2.研究中心。分别设立合肥经济圈、产业承接转移、自主创新、创意产业、城镇化和城乡统筹发展、新农村建设等专业性研究中心，校内外、专兼职研究人员相互配合，积极开展相应区域和领域的高水平研究。3.咨询服务部。主要承担省各厅局、各地方政府、企业委托项目的洽谈、组织和完成工作；承担决策咨询工作的协调和管理任务，组织校内外力量开展决策咨询研究。4.培训部。负责联络开展各种类型的专业技能培训和在职研究生教育。5.校友通联部。负责沟通、联络全国各地校友，重点做好在（来）肥校友的联络工作。